Ηταν 7 Μαΐου του 2005 όταν ο Πανθρακικός ολοκλήρωνε τον μαραθώνιο του τότε Περιφερειακού Πρωταθλήματος της πρώην Δ’ Εθνικής εξασφαλίζοντας τον τίτλο και την άνοδο στην ανώτερη κατηγορία ως πρωταθλητής.
Μια κατηγορία στην οποία ανέβηκε και δεν ξαναβρέθηκε ποτέ ξανά, καθώς σχετικά γρηγορα ανήλθε στην Β’ Εθνική και μετά στην Super League ενώ όταν χρειάστηκε οικειοθελώς να απαοχωρήσει, αυτό συνέβη με την ομάδα να ξεκινά από το τοπικό της ΕΠΣ Θράκης, στο οποίο και εξακολουθεί να συμμετέχει.
Εκείνη τη σεζόν ο Πανθρακικός έχοντας ως όπλο την καταπληκτική του άμυνα (δέχθηκε μόλις 10 τέρματα σε 30 ματς) αλλά και την κορυφαία επίθεση του πρωταθλήματος (με 71 τέρματα) τερμάτισε 1ος στον 1ο Όμιλο του Περιφερειακού Πρωταθλήματος (Δ’ Εθνική), σημαίνοντας την μεγάλη αντεπίθεση που ολοκληρώθηκε με την άνοδο στην Super League.
Μάλιστα, ολοκλήρωσε την σεζόν στις 7/5/2005 στην Δράμα με εκτός έδρας ισοπαλία με την τοπική Ανακάλυψη, η οποία είχε κατακτήσει την 2η θέση, αλλά βρισκόταν 10 βαθμούς πιο πίσω από την ομάδα της Κομοτηνής.
Στον ίδιο όμιλο συμμετείχαν τότε καταλαμβάνοντας την 6η θέση η Δόξα Ξάνθης, που δεν υπάρχχει πλέον στον ποδοσφαιρικό χάρη, την 7η η Δόξα Γρατινής που ήταν η μοναδική άλλη εκπρόσωπος του νομού Ροδόπης τότε στα εθνικά πρωταθλήματα και είχε βάλει με εκείνη την πορεία της τις βάσεις για την επόμενη ονειρεμένη χρονιά της ανόδου, ο Ορέστης Ορεστιάδας, ο ΑΟ Βιστωνίδας και ο Ορφέας Ξάνθης.
Αναλυτικά τα αποτελέσματα του Πανθρακικού εκείνη τη σεζόν:
26/09/04, 1η αγωνιστική: Πανσουλιακός Νέου Σουλίου – Πανθρακικός 0-3
03/10/04, 2η αγωνιστική: Πανθρακικός – Ορφέας Ξάνθης 3-0
10/10/04, 3η αγωνιστική: Μέγας Αλέξανδρος Ηράκλειας – Πανθρακικός 1-1
17/10/04, 4η αγωνιστική: Πανθρακικός – Μέγας Αλέξανδρος Ξηροποτάμου 3-1
24/10/04, 5η αγωνιιστική: Δόξα Γρατινής – Πανθρακικός 1-2
31/10/04, 6η αγωνιστική: Πανθρακικός – ΑΟ Βιστωνίδα 1-0
07/11/04, 7η αγωνιστική: Εθνικός Σιδηροκάστρου – Πανθρακικός 1-0
14/11/04, 8η αγωνιστική: Πανθρακικός – Βισαλτιακός Νιγρίτας 3-0
21/11/04, 9η αγωνιστική: Πανθρακικός – Απόλλων Παραλιμνίου 1-0
28/11/04, 10η αγωνιστική: Ηρακλής Ποταμουδιών Καβάλας – Πανθρακικός 0-1
05/12/04, 11η αγωνιστική: Πανθρακικός – Ορφέας Ελευθερούπολης 5-0
12/12/04, 12η αγωνιστική: Ορέστης Ορεστιάδας – Πανθρακικός 1-2
19/12/04, 13η αγωνιστική: Πανθρακικός – Θεαγένης Θάσου 2-0
09/01/05, 14η αγωνιστική: ΓΣ Προσοτσάνη – Πανθρακικός 0-1
16/01/05, 15η αγωνιστική: Πανθρακικός – Ανακάλυψη Δράμας 0-0
23/01/05, 16η αγωνιστική: Πανθρακικός – Πανσουλιακός Νέου Σουλίου 7-1
30/01/05, 17η αγωνιστική: Ορφέας Ξάνθης – Πανθρακικός 0-5
13/02/05, 18η αγωνιστική: Μέγας Αλέξανδρος Ξηροποτάμου – Πανθρακικός 0-3
20/02/05, 19η αγωνιστική: Πανθρακικός – Δόξα Γρατινής 2-0
23/02/05, 20η αγωνιστική: Πανθρακικός – Μέγας Αλέξανδρος Ηράκλειας 2-1
27/02/05, 21η αγωνιστική: ΑΟ Βιστωνίδα – Πανθρακικός 0-2
06/03/05, 22η αγωνιστική: Πανθρακικός – Εθνικός Σιδηροκάστρου 3-0
12/03/05, 23η αγωνιστική: Βισαλτιακός Νιγρίτας – Πανθρακικός 0-2
20/03/05, 24η αγωνιστική: Απόλλων Παραλιμνίου – Πανθρακικός 1-1
27/03/05, 25η αγωνιστική: Πανθρακικός – Ηρακλής Ποταμουδιών Καβάλας 4-0
03/04/05, 26η αγωνιστική: Ορφέας Ελευθερούπολης – Πανθρακικός 0-2
10/04/05, 27η αγωνιστική: Πανθρακικός – Ορέστης Ορεστιάδας 7-0
17/04/05, 28η αγωνιστική: Θεαγένης Θάσου – Πανθρακικός 1-1
24/04/05, 29η αγωνιστική: Πανθρακικός – ΓΣ Προσοτσάνη 1-0
07/05/05, 30η αγωνιστική: Ανακάλυψη Δράμας – Πανθρακικός 1-1
Δ’ ΕΘΝΙΚΗ ΚΑΤΗΓΟΡΙΑ 2004-2005
Α’ ΟΜΙΛΟΣ – Η ΤΕΛΙΚΗ ΒΑΘΜΟΛΟΓΙΑ
1. Πανθρακικός 77 (71-10)
2. ΑΕ Ανακάλυψη Δράμας 67 (60-25)
3. ΓΣ Προσοτσάνη 54 (45-22)
4. Μέγας Αλέξανδρος Ηράκλειας 51 (47-34)
5. Βισαλτιακός Νιγρίτας 41 (35-30)
6. ΑΟ Βιστωνίδα 41 (36-33)
7. Δόξα Γρατινής 41 (35-35)
8. Απόλλων Παραλιμνίου 40 (37-36)
9. Εθνικός Σιδηροκάστρου 40 (39-40)
10. Ορέστης Ορεστιάδας 40 (51-59)
11. Θεαγένης Θάσου 39 (28-36)
12. Ορφέας Ξάνθης 36 (42-55)
13. Μέγας Αλέξανδρος Ξηροποτάμου 32 (38-50)
14. Πανσουλιακός Νέου Σουλίου 28 (26-53)
15. Ηρακλής Ποταμουδιών Καβάλας 22 (30-65)
16. Ορφέας Ελευθερούπολης 21 (36-59)
