Ο Παναθηναϊκός είναι η δεύτερη ομάδα με την οποία ο ΑΟΞ έχει παίξει τα περισσότερα παιχνίδια στην Α’ Εθνική, 67 στο σύνολο για την ακρίβεια.
Τα τελευταία χρόνια μάλιστα η Ξάνθη δείχνει να του… «έχει πάρει τον αέρα» και παίρνει συχνά θετικά αποτελέσματα στις επισκέψεις της στο λεκανοπέδιο της Αττικής για να τον αντιμετωπίσει.
Συνολικά στην Αθήνα, ΑΟΞ και Παναθηναϊκός έχουν έρθει αντιμέτωποι 33 φορές, με τους γηπεδούχους να μετρούν 23 νίκες, 4 ισοπαλίες και τους Θρακιώτες να φεύγουν με το τρίποντο στις βαλίτσες τους 6 φορές. Υπήρξε κι ένα μοναδικό ματς που διεξήχθη μεν στην Αθήνα, αλλά όχι στην έδρα του Παναθηναϊκού. Το μπαράζ για την ευρώπη το 2013, όπου η Ξάνθη ηττήθηκε με 3-0.
Πρώτο παιχνίδι των δύο ομάδων, στη «Λεωφόρο» το μακρινό 1990, με τελικό σκορ 3-1 και σκόρερ τους Χατζηαθανασίου, Σαραβάκο, Βαζέχα για τους πράσινους και τον Γιώργο Χαλκίδη για την Ξάνθη.
Πρώτη νίκη του ΑΟΞ στην έδρα του Παναθηναϊκου, το 1997, χάρη στα τέρματα των Πέτρου Τεγγελίδη και Νίκου Καραγεωργίου.
Ακολούθησαν αρκετές ήττες για τους Θρακιώτες, ως το 2013 που ξανακέρδισε με 0-1 κι από τότε μετρά 4 νίκες, μια ισοπαλία και μόλις μία ήττα.
Δείτε αναλυτικά την προϊστορία των αγώνων:
1989-1990 Παναθηναϊκός – Ξάνθη 3-1
1990-1991 Παναθηναϊκός – Ξάνθη 6-2
1991-1992 Παναθηναϊκός – Ξάνθη 3-0
1992-1993 Παναθηναϊκός – Ξάνθη 2-0
1993-1994 Παναθηναϊκός – Ξάνθη 5-0
1994-1995 Παναθηναϊκός – Ξάνθη 3-1
1995-1996 Παναθηναϊκός – Ξάνθη 2-0
1996-1997 Παναθηναϊκός – Ξάνθη 1-2
1997-1998 Παναθηναϊκός – Ξάνθη 4-1
1998-1999 Παναθηναϊκός – Ξάνθη 2-1
1999-2000 Παναθηναϊκός – Ξάνθη 2-1
2000-2001 Παναθηναϊκός – Ξάνθη 3-0
2001-2002 Παναθηναϊκός – Ξάνθη 3-1
2002-2003 Παναθηναϊκός – Ξάνθη 1-0 (Κύπελλο Ελλάδος)
2002-2003 Παναθηναϊκός – Ξάνθη 1-0
2003-2004 Παναθηναϊκός – Ξάνθη 1-0
2004-2005 Παναθηναϊκός – Ξάνθη 3-1
2005-2006 Παναθηναϊκός – Ξάνθη 2-1
2006-2007 Παναθηναϊκός – Ξάνθη 1-0
2006-2007 Παναθηναϊκός – Ξάνθη 0-0 (Κύπελλο Ελλάδος)
2007-2008 Παναθηναϊκός – Ξάνθη 0-0
2008-2009 Παναθηναϊκός – Ξάνθη 2-0
2009-2010 Παναθηναϊκός – Ξάνθη 1-0
2010-2011 Παναθηναϊκός – Ξάνθη 1-1
2011-2012 Παναθηναϊκός – Ξάνθη 3-0
2012-2013 Παναθηναϊκός – Ξάνθη 0-1
2013-2014 Παναθηναϊκός – Ξάνθη 2-1
2014-2015 Παναθηναϊκός – Ξάνθη 0-1 (Κύπελλο Ελλάδος)
2014-2015 Παναθηναϊκός – Ξάνθη 2-0
2015-2016 Παναθηναϊκός – Ξάνθη 0-1
2016-2017 Παναθηναϊκός – Ξάνθη 1-2
2017-2018 Παναθηναϊκός – Ξάνθη 1-2
2018-2019 Παναθηναϊκός – Ξάνθη 2-2
