Με τον ίδιο τρόπο όπως και πέρσι θα διεξαχθεί το πρωτάθλημα ανδρών της ΕΚΑΣΑΜΑΘ για την αγωνιστική περίοδο 2016-17.
Οι ομάδες μπορούν να δηλώσουν συμμετοχή μέχρι τη Δευτέρα 1 Αυγούστου, ενώ η κλήρωση του πρωταθλήματος θα γίνει στα γραφεία της Ένωσης την Τετάρτη 31 Αυγούστου στις 17:30, με το πρωτάθλημα να ξεκινάει τον Οκτώβριο.
Στην πρώτη φάση του πρωταθλήματος οι ομάδες θα χωριστούν σε δύο ομίλους με γεωγραφικά κριτήρια, με τους τέσσερις πρώτους κάθε ομίλου να παίρνουν την πρόκριση για τη δεύτερη φάση.
Στη δεύτερη φάση τα ζευγάρια θα είναι Α1-Β4 (1), Α2-Β3 (2), Β2-Α3 (3) και Β1-Α4 (4), με την ομάδα που θα φτάνει στις δύο νίκες στις μεταξύ τους αναμετρήσεις να παίρνει την πρόκριση.
Η ημιτελική φάση και η τελική φάση θα διεξαχθούν σε ουδέτερη έδρα, πάλι με σύστημα Final Four. Τα ζευγάρια στα ημιτελικά θα είναι ο νικητής του ζευγαριού 1 με τον νικητή του ζευγαριού 3 και ο νικητής του ζευγαριού 2 με το νικητή του ζευγαριού 4. Οι ηττημένοι των ημιτελικών θα παίξουν στον μικρό τελικό, ενώ οι νικητές στον μεγάλο, με τον νικητή να αναδεικνύεται πρωταθλητής και να παίρνει την άνοδο στη Γ΄ Εθνική.
